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标签:生态学

海洋浮游植物分布数据的获取及使用-Continuous Plankton Recorder Survey

前言因为目前课题是有关海洋浮游植物的,需要获取到欧洲北海地区浮游植物分种的历史分布情况及丰度,对于observation而言有很多数据库可以操作,比如Ocean Biogeographic Information System (OBIS),就能很方便的获取到各种海洋生物的观测记录(点击查看R代码),我在本博客里后续也会做一些介绍(欢迎右侧搜索关键词OBI……

强烈推荐一个数据集Tara Oceans Expedition (2009-2013) |海洋微生物基因组学

简介由联合国环境署(UNEP)斥资,历时三年半(2009.11-2013.05)的Tara Oceans Expedition告一段落,在Science杂志上以封面形式重磅发布其研究成果,通过5篇论文揭开海洋微生物的神秘面纱。为研究全球变暖对海洋生物多样性的影响,科学家们横跨大西洋、太平洋、南极和印度洋70000英里海域,探究浮游生物在地球生命系统中的角……

NOAA气象数据全站镜像|包括全球2万多站点的长期气象数据|日值逐小时

只要15块,买不了吃亏买不了上当:https://www.cloudraft.cn/cart.php?gid=4订阅后无任何下载限制,永久更新NOAA所有数据开通后获得2ndTech私有云服务账号,支持WebDAV、在线网页界面下载所有数据5TB大数据库,1G/s网口下载不限量不限速!定期更新包含数据集:daily-ghcndaily-gsod……

R语言中在表格中显示Tukey HSD事后检验的分组结果|和SPSS一样可视化ANOVA方差分析

在多层次方差分析之后,我们可能需要看看到底是哪些处理组之间有显著差异,或者虽然ANOVA结果是显著的但是我们还要看看哪些处理组之间是不显著的,这种时候我们就需要TukeyHSD事后检验了。用过SPSS的人应该知道,SPSS的事后检验结果非常的人类友好——可读性很高,会把每个层次的处理告诉你,但是R自带的结果就非常不友好了...我拿同一组数据在R和SPSS里跑……

Centos7上的SF安装——GIS依赖包

依赖列表gdal> = 2.1#用于数据结构geos> = 3.5#用于数据操作pro4j#用于投影udunits#为单位的PostgreSQL [可选]lwgeom [可选]#对于geohashCentos7默认仓库为您提供gdal1.1,geos 2.x. 但是,sf :: st_voronoi需要geos> =……

[已解决]"checking for gdal-config... no" 安装gdal2.x——R语言中GIS包rgdal的依赖包|CentOS7为例

在编译R环境的时候,最讨厌的额就是一些特殊的依赖包,只能通过ssh安装,而且还经常找不到这些包或者是版本不匹配...这次的gdal 2.x就是一个例子,浪费了我很长的时间去找相关的安装方法,这里记一下笔记,下次碰到了的话就方便了。这里还是强烈建议,安装各种包之前看一看包的介绍:packages/rgdal。 有很明确的说明需要什么样子的环境:for bu……

使用ggplot2中的分面参数facet对数据进行分类作图/分页/一页多图

最近在整理文章用到的分析的代码,准备发表的时候一并上传给大家作参考,所以要仔细检查有没有错误或者是可以优化代码的地方。这里给大家介绍一下ggplot2里一个超级好用的参数:facet。用过R的应该都知道,普通的绘图我们可以用par(nfrow())来进行分页,但是这一方法在ggplot2中并不适用,事实上ggplot2的facet更加好用一些,可以自动帮你……

使用R语言插入缺失数据-平均值法(附代码)

做实验嘛总会莫名其妙少掉一些样本,但是样本少了文章还是要写啊!那么缺失了数据对分析有什么影响呢?我觉得最重要的影响应该是权重的变化,这里用我这次的实验数据做例子吧:本实验是研究9个不同来源地(纬度梯度下)的植物凋落物分解速率的差异,同时还有3种不同的凋落物袋看分解者和来源地的交互作用,具体可以看这个poster:Poster (draft) of [R……

获取指定地区的精确气象信息:日均温度、昼夜温差、降雨量等

干货注册中国气象数据网的账号:点我注册 ,然后等待审核确认。【注意】一定要选择实名注册,否则大部分数据都不能下载!!等审核确认之后,进入国家气象科学数据共享服务平台,在导航栏选择【数据服务】,选择自己需要的数据即可下载。部分数据可以直接在线获取,例如全球地面气象站定时观测资料,就可以直接在线获取气压, 温度/气温, 相对湿度, 降水量等数据:注意……