合并fastq测序数据不同泳道的同一个样品测序数据经过质量检查QC后是可以合并的。本例中文件命名情况如下：示例文件名：83b_S156_L004_R1_001.fastq.gz，其中83b_S156是样品名，L004是泳道，R1是正向序列。这时候只需要用这个小脚本即可：ls *R1* | cut -d _ -f 1,2 | sort | uniq……Continue reading » Jason 3 years ago (2021-02-04) 612Views 0Comments2个赞
安装FScache模块yum -y install cachefilesdsystemctl enable cachefilesdsystemctl start cachefilesd配置参数默认配置文件在/etc/cachefilesd.conf，其中第一行是SSD缓存的位置，我因为系统盘是SSD所以没有做任何修改，有兴趣可以研究一下……Continue reading » Jason 3 years ago (2021-01-30) 610Views 0Comments1个赞
批量关闭（软关机）for i in $(virsh list --name --autostart); do virsh shutdown $i; done批量关闭（硬关机）for i in $(virsh list --name --autostart); do virsh destroy $i; done批量开启for i ……Continue reading » Jason 3 years ago (2021-01-29) 697Views 0Comments1个赞
前言如果手上经常有大量数据需要跨服务器转移，那么rsync真的是个好东西！功能非常的丰富，这里记录一下自己实际使用的案例，不定期增加内容和更新。inplace参数：实现块文件/镜像文件增量备份与复制简而言之就是：1. rsync默认情况下是将更新的文件复制到目标路径后替换旧文件default method of creating a new cop……Continue reading » Jason 3 years ago (2021-01-27) 690Views 0Comments1个赞
没啥好说的，就是修改Ceph集群里存储池pool的CrushRule规则、备份数size和最小备份数min_size修改CrushRule：ceph osd pool set [存储池名] crush_rule [CrushRule规则名]修改默认备份数：ceph osd pool set [存储池名] size [份数]修改最小备份数（低于这个就停止……Continue reading » Jason 3 years ago (2021-01-26) 571Views 0Comments1个赞
官方的帮助文档中描述是：ceph crush rule create-replicated default 建立纯ssd的crush规则： ceph osd crush rule create-replicated ssd-pool default host ssd建立纯ssd的crush规则： ceph osd crush rule……Continue reading » Jason 3 years ago (2021-01-26) 538Views 0Comments1个赞
收到通知...貌似要绝版了，这边收藏一份：……Continue reading » Jason 3 years ago (2021-01-25) 961Views 0Comments2个赞
如果是全新新建的话，直接用这个就行了：sudo ceph-volume lvm create --data /dev/sda3 --crush-device-class ssd记得用fdisk进行分区，例子中是sda3作为osd的分区，ssd是crush中的磁盘类型如果因为连接cluster失败的话，先初始化pveceph init，并更新ke……Continue reading » Jason 3 years ago (2021-01-25) 599Views 0Comments1个赞
前言由于某个API的特殊需求，在url中会出现两次?，例如:https://api.cloudraft.cn/?https://api.cloudflare.com/client/v4/zones/03bfeae5bfad300000000563011154cb/dns_records?&per_page=10&page=1这种时候……Continue reading » Jason 3 years ago (2021-01-24) 634Views 0Comments0个赞
前言继续配置RouterOS，这次是开启IPv6下发和转发功能，由于之前在Windows Server下的种种尝试，这次没有到处找教程啥的，直接上手配置就搞定了。这里分享一下过程吧~开启IPv6功能首先开启IPv6模块，这个我找了半天才发现默认是关闭的...在System>Packages里，找到IPv6，开启这个插件。开启后是不会立刻生效的……Continue reading » Jason 3 years ago (2021-01-19) 1032Views 0Comments1个赞
